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堆肥發酵大致上分為厭氧發酵及好氧發酵

　　厭氧發酵是將廚餘置於桶中並添加厭氧菌，密封後使其發酵，此種方式固然方便且可避免臭味四溢，但是殊不知再密封的狀態下，許多物質是無法完全轉化的，雖然堆肥液體中含有許多植物生長所需的養分，但不需要的物質也因此被作物吸收，而食用這些作物後可能對人體有害；且在廚餘中含有大量鹽份及油脂，長期使用廚餘液肥，可能導致土壤酸化、鹽份提高，進而導致土壤品質下降，而自製廚餘液肥的成份卻無法經過肉眼或簡易實驗可以檢測，在商品化的大力推廣下，只能自求多福。據知農政單位從來未曾推廣以厭氧發酵的方式處理廚餘。而完全以厭氧發酵的方式處理下，不管堆積多久，都不可能得到無臭無害的有機肥。

　　廚餘若要無害，建議以好氣發酵的方式操作，並添加大量植物性材料（例如：生蔬果殘體、稻殼、堆積過的木屑、枯枝落葉、椰纖屑...等），調整水份在60%，至少經過翻堆發酵２個月以上，才可能得到無害優質的堆肥。

　　廚餘堆肥越來越盛行，但是在相關資訊及知識不足的情形下，消費者只能比照產品說明操作，但是真的能吃到更健康的蔬菜嗎？堆肥會比買的肥料更安全嗎？值得花友們深思！